李玮锋的这四年，与中国足球的命运极其相似而又紧紧相连。
2005年年初，李玮锋的恩师朱广沪入主国家队，李玮锋也成为国家队位置最稳定的中卫人选。2005年7月31日，东亚四强赛对阵韩国时，比赛刚刚进行到第3分钟，他在推倒韩国后卫刘庆烈之后，又掌掴了对手，然而，日本主裁判错误地对郜林出示红牌将其罚下。第81分钟到第83分钟，李玮锋又连吃两张黄牌，终于被红牌罚下场，赛事组委会之后对他作出追加停赛两场的处罚。从这场比赛开始，李玮锋被冠以“吃牌大户”的恶名。
2006年，李玮锋从深圳队转会至上海申花，职业生涯进入新的一页。但就是在这一年，李玮锋的国家队生涯跌入低谷。2006年10月2日，中国足协开展整风运动，作出了“撤销李玮峰队长取消国脚资格”的处分决定，李玮锋为他这两年频频染红犯规，付出了沉重的代价。
2007年，由于中国队面临亚洲杯的任务，在被开除出国家队170天之后，2007年3月27日在澳门，李玮锋重新入选了朱家军，并参加了与乌兹别克队的友谊赛。随后，李玮锋参加了亚洲杯。前两场比赛，一胜一平，只要最后一场打平就可以出线，然而，李玮锋累积两张黄牌，与郑智一起缺席最后一场与乌兹别克的比赛，结果国足大败小组未能出线。
2008年对于本来李玮锋十分重要，一是自己国家队出场100场的记录来到，另外便是作为国家队队员，可能是最后一次冲击世界杯。遗憾的是，李玮锋在2008年2月20日重庆举行的东亚四强赛与日本队的比赛中，出手掐日本球员铃目启太的脖子，被主裁判出示黄牌，因累积两张黄牌而无缘接下来的比赛，这也使他不得不将国足百场庆典推迟到了3月15日———与泰国的热身赛。随着中国队在世界杯预选赛小组赛上主场两连败，李玮锋第二次进入世界杯的梦想也彻底破灭。
